下屬機構：黃東海浮標觀測站、膠州灣海洋生態系統國家野外研究站、長江口海洋生態系統研究站。 

　　主要職責：負責海洋觀測網絡的運行、維護與管理，負責所屬臺站建設與運行，構建海岸帶-近海-大洋的綜合觀測體系，提供高質量長時序多參數的基礎觀測數據，形成資源開放共享機制。